学校现有一级学科博士学位授予点15个，博士专业学位授予点5个， 覆盖了农学、理学、工学、管理学4大学科门类。
一级学科博士学位授权点（15个）
| 代码 | 学科名称 | 代码 | 学科名称 |
| 0710 | 生物学 | 0903 | 农业资源利用 |
| 0713 | 生态学 | 0904 | 植物保护 |
| 0828 | 农业工程 | 0905 | 畜牧学 |
| 0832 | 食品科学工程 | 0906 | 兽医学 |
| 0907 | 林学 | 0836 | 生物工程 |
| 0908 | 水产 | 0901 | 作物学 |
| 1203 | 农林经济管理 | 0902 | 园艺学 |
| 1204 | 公共管理 |
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专业学位博士点（5个）
| 代码 | 学科名称 | 代码 | 学科名称 |
| 0854 | 电子信息 | 0951 | 农业 |
| 0860 | 生物与医药 | 0952 | 兽医 |
| 0862 | 风景园林 |
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